1945年11月25日晚，云南昆明几个大学师生在西南联合大学召开反内战的时事讨论会，6000余人参加，钱端升、费孝通等教授演讲。国民党昆明防守司令部派第五军邱清泉部包围会场，百余名特务冲进会场捣乱。次日，昆明30000名学生举行罢课，抗议军警破坏晚会的暴行，要求取消禁止自由集会的禁令，反对内战，呼吁美军撤离中国。
12月1日，国民党军政部所属第二军官总队和特务暴徒数百人，围攻西南联大、云南大学等校，毒打学生，并投掷手榴弹，炸死联大学生李鲁连、潘琰(女)和昆华工校学生荀继中，南青中学教师于再4人；60余名学生被打伤。“一二一”昆明惨案的真相迅速传遍全国。重庆、成都、延安、遵义、上海等地集会游行，声援昆明学生。自此，一个以学生运动为主的反内战运动，一时席卷国民党统治区。
事件发生后，全国各地学生举行抗议和示威游行，各界人士也纷纷谴责国民党的暴行。在全国人民的压力下，蒋介石让云南警备司令关麟征“自请处分”，云南省代理主席李宗黄调离。