1900年9月3日，八国联军在京城继续搜杀义和团，并不断往近畿各地发兵剿团。市民见“俄兵大队自崇文门而北，系在近畿剿义和团，奏凯而旋，获团旗甚多，挟之马上。美兵亦有出队者。”
5日，“各处洋人在街巷挨户捉人，名曰苦力，与之赴城外四乡割打高粱、玉米、青草，抬送至各驻兵之处喂马。来往皆有洋人押随，稍不努力，即遭毒打，苦不可言，无论仕农工商一并捉拿，多有全家被捉者”。
7日，八国联军轰西红门团民。“又黄村拳亦不少，洋兵往击散，遂乘势轰其村，平之”。赫德与奕匡言：“近日南苑内时有枪声，经洋兵十余人驰往攻击，竟枪毙义和拳数百”。
11日，联军1700余人，携大炮6门，又攻良乡县城。义和团阵亡250余人，城破。团民被杀无数。联军凯歌返京。目击者说：“洋兵大队鼓乐由彰仪门入者千余。领队者，执良乡某屯义和团旗，又有清道旗一面，复有十余旗，皆大书‘义和团’，又有‘守望相助’字样；并有拳匪刀矛多件。步队在前，马队在后，炮车夹而行。尾车拴黄牛三，驴一。”良乡团民“计死四千余人。”
同日，京师户部衙署被焚，延及礼部。因“户部银库钱库均被各国盗劫一空，故放火焚烧以绝口实”。
16日，八国联军组成“征讨队”前往八大处一带剿杀义和团，炸毁宝塔一座，焚毁灵光寺、笔墨园等处寺庙。
19日，联军往京郊西山观音村剿杀义和团，全村为炮火所毁，团民百余人被杀。