为进一步深化医改，落实好医疗、医保、医药“三医联动”改革，提高医保基金使用效益、遏制不正确医疗行为、减轻群众看病负担、提高群众医疗保障水平，7月10日，三明市在全国率先成立医疗保障管理局，这是该市深化基层卫生综合改革的又一重大举措。
据悉，三明市医疗保障管理局与市财政局合署办公，将市人力资源和社会保障管理局有关医疗保险、生育保险管理职责，市卫生和计划生育委员会有关药品集中采购管理职责，市财政局有关拟订医保基金、生育基金的预决算（草案）职责，市医疗保障基金管理中心有关医疗保险定点医疗机构、市本级定点零售药店的资格审查、管理等职责进行整合，划入新成立的医疗保障管理局。
新的医疗保障管理局将负责贯彻落实国家、省和市委、市政府医药卫生体制改革的决策部署，统筹决策、研究部署市医药卫生体制改革工作。负责全市基本医疗保险基金、生育保险基金的筹集征缴、收支预算决算和监督管理。制定基本医疗保险、大病统筹保险、生育保险的报销目录（限价目录）、报销比例、付费标准等政策，制定第三次精准补助、公务员医疗补助、机关事业单位女工生育补助等政策，并对实施政策情况的监督管理。
三明市医疗保障管理局还将负责全市定点医疗机构、定点零售药店、定点理疗康复机构、定点医养结合点、区域外转诊就医的审批和监督管理。负责制订和落实全市药品、耗材、医疗设备联合采购管理办法，监督管理药品、耗材采购、配送、结算工作。负责确定和修订医疗服务价格。负责补充医疗保险、补充生育保险的衔接协调及其招投标和日常监督管理。负责规划和组织实施全市医疗保障信息系统建设等。