1993年3月6日，经过一年多的反复酝酿，中国科学院推出90年代综合配套改革方案，将科研结构的调整与人事、分配制度和机关管理、社会保障体系的改革配套进行。
中科院将继续重视和加强基础性研究，为基础性研究创造一个相对稳定和优越的环境，同时对基础研究工作队伍进行适当的结构调整。在5至10年内，将固定研究人员精干到现有科研人员的15％左右，流动客座的基础研究人员要超过基础队伍的半数以上。对从事资源、环境、生态等基础性研究的队伍， 5至10年内也要保持在全院现有科研人员的15％左右。
中科院今后的经费支持将逐步向长远性、基础性研究倾斜，同时要转变机制，面向市场，以多种形式、多种层次进入社会主义市场经济领域，实现70％科技力量走上经济建设主战场在应用研究与技术开发方面，逐步向企业管理方向过渡。
中科院新闻发言人告诉记者，未来科学院的构成是：全国学部委员组成的学部；从事基础研究和社会公益型研究的精干核心；一批已经转变机制、面向市尝经济自立、有自我发展能力的应用性研究所。工程中心；一批以股份联系的硅谷式小企业及有相当规模的综合性、外向型高技术企业集团。