茶树油以具有抗菌作用而知名，而头皮屑往往是由真菌滋生导致，因此用茶树油治头皮屑是一种有效的传统偏方。不过，针对这一课题的研究结果并不统一。有些情况下，茶树油有效，但也有人用后看不出效果。建议多尝试几种天然去屑偏方，如橄榄油或椰子油等，从中找出对自己有效的一种。这些油都有强大的抗真菌作用。
造成头皮屑的其中一个主要原因是叫做皮屑芽胞菌（也称为球形马拉色菌）的类酵母菌。滋生这种真菌通常由卫生不良，压力，荷尔蒙失衡和其它健康问题引起。皮屑芽胞菌以皮脂腺分泌物为食，并因此造成头皮发炎。这会导致头皮发痒，并最终起皮脱落。
许多专门设计配方的茶树油去屑洗发水，有预防和治疗头皮屑作用。但在购买时不要忘记查看成分，洗发水包含的茶树油至少达到5%才有疗效。此外，单独购买浓缩茶树油，然后与普通洗发水混合后洗发也是可行的办法。
如果分开买，在洗发前先用茶树油按摩头皮，停留20分钟后漂洗干净即可。如果用包含茶树油的去屑洗发水，打出泡沫后停留5分钟，然后用清水漂洗干净。每周用这些茶树油去屑偏方至少三次才能获得理想效果。
建议敏感皮肤或容易过敏的人在使用茶树油之前做局部皮测。有些人对这种油有过敏反应。浓缩茶树油特别强大，会刺激皮肤，因此建议用橄榄油或椰子油稀释后使用。
茶树油有毒性，因此绝对不要摄入。它会消弱免疫系统和中枢神经系统，并且还会造成荷尔蒙失衡。如果在使用后出现呕吐，腹泻或困乏等不良反应，应马上咨询医生。此外，不建议孕妇或哺乳母亲用这种油或相关产品，最好选择更安全的天然去屑配方。